分子生物学常用溶液的配制

take1860 发表于 2010-07-08 02:05:29

(1)在配制溶液前,请先计算所配试剂中各成分的用量。

DNA连接失败(以T4 DNA连接酶为例)常见问题与解决方案

take1860 发表于 2010-07-08 01:53:43

⑴ 可能是因为反应体系内无ATP或Mg2+导致连接失败,解决方案:使用随酶提供的buffer或向其它兼容的buffer中加入ATP。含ATP的Buffer保存超过1年,其内ATP可能会降解,导致连接失败。当补加ATP时,确定补加的是核糖核酸ATP,而不是脱氧核糖核酸ATP,因为后者不起作用;
关键词(Tag): dna连接

转化的大肠杆菌为什么不长?

take1860 发表于 2010-07-08 01:52:21

 

A)检查感受态细胞是否有问题,不管公司的也好自己做的也好,转化连接产物时同时转化一只质粒,作为对照。

B)连接T的时候,保证连接比例没有问题。连接时间可以适当延长,但是试剂盒的连接往往效率很高,连接时间不是大问题。

C)转化的细节处理:加培养基复苏:摇1h的话,可以多加入一些培养基,此时培养基一定不要加入抗性!摇1h复苏,摇速在150rpm先摇30min

D)涂板时来回轻轻涂布,感觉大多数地方都涂到即可,不要反复用力涂布,不要把涂布环或者涂布棒烧的过热,或者不待冷却就涂。切记感受态细胞比较娇嫩。

E)检查一下琼脂板是否有问题。

F)检查一下抗生素在配置过程中是否出错,有没有加错。

IPTG用于诱导lac、tac启动子的转录,但其本身具有一定的毒性,若用于医疗目的的重组蛋白并不适合。该如何解决这一问题?

take1860 发表于 2010-07-08 01:51:26

有两种解决方法:(1)把阻遏蛋白lacⅠ的温度敏感突变株lacⅠ(ts)插入表达载体或整合到染色体后,均能使lac、tac启动子的转录受到温度严谨调控,在较低温度(30℃)时抑制,在较高温度(42℃)时开放;(2)用乳糖替代IPTG,但其效率受到多种因素的影响和制约,因此乳糖诱导的有效剂量大大高于IPTG。乳糖本身作为一种碳源可以被大肠杆菌代谢利用,较多的乳糖存在也会导致菌体生理及生长特性变化。乳糖代替IPTG作为诱导剂的研究要与发酵工艺结合起来,才能显示其良好的前景。

影响感受态细胞转化效率的因素及实际操作过程中应注意的事项有哪些?

take1860 发表于 2010-07-08 01:49:16

      A)细菌的生长状态:实验中应密切注视细菌的生长状态和密度,尽量使用对数生长期的细胞(一般通过检测OD600来控制。DH5α菌株OD600为0.5时细胞密度是5×107/ml);
关键词(Tag): 感受态细胞

平端连接注意事项

take1860 发表于 2010-07-05 00:30:10

  (1)插入片断和载体片断的比例要高。
(2)连接酶要加的多点,最好用高浓度的酶。
关键词(Tag): 平端连接

粘端连接注意事项

take1860 发表于 2010-07-05 00:28:55

(1)连接反应的温度:DNA连接酶的最适反应温度为37℃,但在此温度下,粘性末端的氢键结合很不稳定,折衷方法是12℃过夜。
(2)DNA的平未端和粘性末端:由于内切酶产生的DNA末端有平未端和粘性末端,因而连接反应中就有平未端连接和粘性末端连接。二者连接效率不同。粘性末端效率高,因而在底物浓度,酶浓度选择上是有差异的。
关键词(Tag): 粘端连接

DNA的连接反应中TA克隆连接失败或效率低的可能原因

take1860 发表于 2010-07-05 00:26:13

(1)连接缓冲液活性低,ATP降解或缓冲液稀释不当

对策:使用一次性分装的缓冲液,避免反复冻融。提供的T4连接酶缓冲液为十倍浓度,正确稀释。

(2)连接酶失活 对策:更换连接酶
关键词(Tag): ta克隆连接